Если ты знаешь что такое "русская матрёшка", то понимаешь ПОЧЕМУ так называют этот контейнер.
В нём как в "русской матрёшке" сложено МНОЖЕСТВО потоков (как правило).
Вот почему на компьютерном сленге контейнер
.mkv ЧАСТО (не все и не всегда) называют "матрёшкой", а не за схожесть в произношении с "матроской".
ЗЫ, А определение "гнездящейся кукла" - улыбнуло
PPS. Кстати, есть ещё одна программа
meGUI, но она более сложная, хотя и более "продвинутая". Не стал её описывать именно из-за сложности, но попробовать советую. Немного описания работы
есть тут.